Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVW-1Q9UQF0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVW-1Q9UQF0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVW-1Q9UQF0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERVW-1Q9UQF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.9 ms