Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFDN2Q9UHV9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PFDN2Q9UHV9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN2Q9UHV9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN2Q9UHV9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PFDN2Q9UHV9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN2Q9UHV9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN2Q9UHV9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms