Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3KQ9UBQ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3KQ9UBQ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3KQ9UBQ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3KQ9UBQ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3KQ9UBQ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3KQ9UBQ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3KQ9UBQ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms