Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC51.7■■■■■ 5.87
BICRAQ9NZM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC51.7■■■■■ 5.87
BICRAQ9NZM4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
BICRAQ9NZM4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC51.66■■■■■ 5.86
BICRAQ9NZM4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.6■■■■■ 5.85
BICRAQ9NZM4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC51.59■■■■■ 5.85
BICRAQ9NZM4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.58■■■■■ 5.85
BICRAQ9NZM4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC51.56■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC51.53■■■■■ 5.84
BICRAQ9NZM4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC51.49■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC51.45■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC51.45■■■■■ 5.83
BICRAQ9NZM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC51.44■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.38■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC51.38■■■■■ 5.82
BICRAQ9NZM4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.37■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC51.32■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.81
BICRAQ9NZM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
BICRAQ9NZM4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC51.25■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC51.25■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC51.21■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
BICRAQ9NZM4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.17■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC51.16■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.15■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC51.13■■■■■ 5.78
BICRAQ9NZM4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC51.11■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC51.07■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC51.07■■■■■ 5.77
BICRAQ9NZM4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC51.06■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.06■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.03■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
BICRAQ9NZM4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC50.98■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC50.98■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC50.96■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.96■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC50.95■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
BICRAQ9NZM4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC50.92■■■■■ 5.74
BICRAQ9NZM4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
BICRAQ9NZM4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
BICRAQ9NZM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms