Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM30AQ9NV96 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM30AQ9NV96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM30AQ9NV96 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM30AQ9NV96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM30AQ9NV96 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM30AQ9NV96 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM30AQ9NV96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM30AQ9NV96 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms