Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACKR4Q9NPB9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACKR4Q9NPB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACKR4Q9NPB9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACKR4Q9NPB9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACKR4Q9NPB9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR4Q9NPB9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms