Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C5orf42Q9H799 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C5orf42Q9H799 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C5orf42Q9H799 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C5orf42Q9H799 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C5orf42Q9H799 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C5orf42Q9H799 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C5orf42Q9H799 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms