Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRMDAQ9H2I8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRMDAQ9H2I8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRMDAQ9H2I8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRMDAQ9H2I8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRMDAQ9H2I8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRMDAQ9H2I8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRMDAQ9H2I8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRMDAQ9H2I8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms