Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA10Q9GZZ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNA10Q9GZZ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA10Q9GZZ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA10Q9GZZ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA10Q9GZZ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
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