Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMD2Q9BT23 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMD2Q9BT23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIMD2Q9BT23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIMD2Q9BT23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIMD2Q9BT23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMD2Q9BT23 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIMD2Q9BT23 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms