Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CELF1Q92879 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CELF1Q92879 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CELF1Q92879 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CELF1Q92879 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CELF1Q92879 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CELF1Q92879 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CELF1Q92879 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CELF1Q92879 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CELF1Q92879 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CELF1Q92879 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CELF1Q92879 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CELF1Q92879 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CELF1Q92879 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CELF1Q92879 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CELF1Q92879 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CELF1Q92879 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CELF1Q92879 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CELF1Q92879 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CELF1Q92879 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CELF1Q92879 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms