Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DCAF4Q8WV16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DCAF4Q8WV16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DCAF4Q8WV16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DCAF4Q8WV16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DCAF4Q8WV16 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DCAF4Q8WV16 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DCAF4Q8WV16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DCAF4Q8WV16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DCAF4Q8WV16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DCAF4Q8WV16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DCAF4Q8WV16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DCAF4Q8WV16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DCAF4Q8WV16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
DCAF4Q8WV16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
DCAF4Q8WV16 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DCAF4Q8WV16 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DCAF4Q8WV16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DCAF4Q8WV16 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms