Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAT3Q8TDW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAT3Q8TDW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAT3Q8TDW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAT3Q8TDW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAT3Q8TDW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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