Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVIPQ8NHG7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVIPQ8NHG7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVIPQ8NHG7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVIPQ8NHG7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SVIPQ8NHG7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms