Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KLHL34Q8N239 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KLHL34Q8N239 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms