Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX18

DHX40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX40Q8IX18 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DHX40Q8IX18 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DHX40Q8IX18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DHX40Q8IX18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DHX40Q8IX18 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DHX40Q8IX18 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DHX40Q8IX18 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DHX40Q8IX18 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DHX40Q8IX18 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX40Q8IX18 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DHX40Q8IX18 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX40Q8IX18 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DHX40Q8IX18 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DHX40Q8IX18 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DHX40Q8IX18 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DHX40Q8IX18 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms