Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MARCH9Q86YJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH9Q86YJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH9Q86YJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MARCH9Q86YJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MARCH9Q86YJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MARCH9Q86YJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MARCH9Q86YJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH9Q86YJ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH9Q86YJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH9Q86YJ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCH9Q86YJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms