Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM17Q86X19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM17Q86X19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM17Q86X19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM17Q86X19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms