Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PACS2Q86VP3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACS2Q86VP3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACS2Q86VP3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PACS2Q86VP3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACS2Q86VP3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PACS2Q86VP3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms