Protein–RNA interactions for Protein: Q86U06

RBM23, Probable RNA-binding protein 23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM23Q86U06 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM23Q86U06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM23Q86U06 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM23Q86U06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM23Q86U06 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM23Q86U06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RBM23Q86U06 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM23Q86U06 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM23Q86U06 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms