Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMC4Q7Z404 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TMC4Q7Z404 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMC4Q7Z404 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMC4Q7Z404 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMC4Q7Z404 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMC4Q7Z404 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMC4Q7Z404 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMC4Q7Z404 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMC4Q7Z404 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TMC4Q7Z404 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TMC4Q7Z404 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TMC4Q7Z404 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TMC4Q7Z404 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TMC4Q7Z404 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TMC4Q7Z404 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMC4Q7Z404 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMC4Q7Z404 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TMC4Q7Z404 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TMC4Q7Z404 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TMC4Q7Z404 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms