Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETXQ7Z333 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETXQ7Z333 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETXQ7Z333 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETXQ7Z333 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETXQ7Z333 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETXQ7Z333 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETXQ7Z333 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETXQ7Z333 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms