Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
OTOP1Q7RTM1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
OTOP1Q7RTM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
OTOP1Q7RTM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
OTOP1Q7RTM1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
OTOP1Q7RTM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
OTOP1Q7RTM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
OTOP1Q7RTM1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.9 ms