Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KNDC1Q76NI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KNDC1Q76NI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
KNDC1Q76NI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
KNDC1Q76NI1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KNDC1Q76NI1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KNDC1Q76NI1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KNDC1Q76NI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
KNDC1Q76NI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KNDC1Q76NI1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
KNDC1Q76NI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.65
KNDC1Q76NI1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
KNDC1Q76NI1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
KNDC1Q76NI1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
KNDC1Q76NI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KNDC1Q76NI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KNDC1Q76NI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KNDC1Q76NI1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms