Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CASC2Q6XLA1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASC2Q6XLA1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC2Q6XLA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms