Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HRCT1Q6UXD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HRCT1Q6UXD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HRCT1Q6UXD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HRCT1Q6UXD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms