Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
VSTM1Q6UX27 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VSTM1Q6UX27 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSTM1Q6UX27 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VSTM1Q6UX27 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VSTM1Q6UX27 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSTM1Q6UX27 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSTM1Q6UX27 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms