Protein–RNA interactions for Protein: Q6RSH7

VHLL, von Hippel-Lindau-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLLQ6RSH7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLLQ6RSH7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VHLLQ6RSH7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VHLLQ6RSH7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLLQ6RSH7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLLQ6RSH7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLLQ6RSH7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLLQ6RSH7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLLQ6RSH7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLLQ6RSH7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLLQ6RSH7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms