Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BRWD3Q6RI45 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BRWD3Q6RI45 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BRWD3Q6RI45 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
BRWD3Q6RI45 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BRWD3Q6RI45 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BRWD3Q6RI45 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BRWD3Q6RI45 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BRWD3Q6RI45 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BRWD3Q6RI45 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
BRWD3Q6RI45 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BRWD3Q6RI45 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BRWD3Q6RI45 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BRWD3Q6RI45 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BRWD3Q6RI45 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
BRWD3Q6RI45 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRWD3Q6RI45 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRWD3Q6RI45 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BRWD3Q6RI45 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BRWD3Q6RI45 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BRWD3Q6RI45 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BRWD3Q6RI45 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BRWD3Q6RI45 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BRWD3Q6RI45 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms