Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIY7

PAPD4, Poly(A) RNA polymerase GLD2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD4Q6PIY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAPD4Q6PIY7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPD4Q6PIY7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPD4Q6PIY7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAPD4Q6PIY7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAPD4Q6PIY7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAPD4Q6PIY7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPD4Q6PIY7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAPD4Q6PIY7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms