Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF544Q6NX49 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF544Q6NX49 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF544Q6NX49 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF544Q6NX49 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF544Q6NX49 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF544Q6NX49 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF544Q6NX49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms