Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD276Q5ZPR3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD276Q5ZPR3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD276Q5ZPR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD276Q5ZPR3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD276Q5ZPR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms