Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
C9orf84Q5VXU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.02■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
C9orf84Q5VXU9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
C9orf84Q5VXU9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
C9orf84Q5VXU9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
C9orf84Q5VXU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
C9orf84Q5VXU9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
C9orf84Q5VXU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.69■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
C9orf84Q5VXU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
C9orf84Q5VXU9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
C9orf84Q5VXU9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
C9orf84Q5VXU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms