Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A1-AS1Q5TC04 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP1A1-AS1Q5TC04 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP1A1-AS1Q5TC04 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A1-AS1Q5TC04 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms