Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HIVEP3Q5T1R4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HIVEP3Q5T1R4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HIVEP3Q5T1R4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HIVEP3Q5T1R4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIVEP3Q5T1R4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIVEP3Q5T1R4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms