Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVEP1Q4LDE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVEP1Q4LDE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SVEP1Q4LDE5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SVEP1Q4LDE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SVEP1Q4LDE5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVEP1Q4LDE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms