Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP19-7Q3SYF9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP19-7Q3SYF9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP19-7Q3SYF9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP19-7Q3SYF9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP19-7Q3SYF9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP19-7Q3SYF9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms