Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP25-1Q3LHN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP25-1Q3LHN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
KRTAP25-1Q3LHN0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms