Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX17Q15036 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNX17Q15036 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SNX17Q15036 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX17Q15036 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SNX17Q15036 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
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SNX17Q15036 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX17Q15036 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX17Q15036 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNX17Q15036 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNX17Q15036 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
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