Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PKP1Q13835 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PKP1Q13835 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PKP1Q13835 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKP1Q13835 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PKP1Q13835 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PKP1Q13835 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKP1Q13835 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PKP1Q13835 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
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