Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTK7Q13308 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTK7Q13308 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTK7Q13308 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTK7Q13308 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTK7Q13308 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTK7Q13308 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTK7Q13308 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PTK7Q13308 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTK7Q13308 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTK7Q13308 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTK7Q13308 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTK7Q13308 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTK7Q13308 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTK7Q13308 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTK7Q13308 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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