Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRSF5Q13243 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRSF5Q13243 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRSF5Q13243 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRSF5Q13243 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRSF5Q13243 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRSF5Q13243 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRSF5Q13243 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRSF5Q13243 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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