Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREMQ03060 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREMQ03060 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CREMQ03060 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CREMQ03060 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREMQ03060 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CREMQ03060 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CREMQ03060 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREMQ03060 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CREMQ03060 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREMQ03060 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREMQ03060 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CREMQ03060 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREMQ03060 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREMQ03060 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CREMQ03060 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREMQ03060 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREMQ03060 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREMQ03060 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREMQ03060 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CREMQ03060 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CREMQ03060 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CREMQ03060 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CREMQ03060 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CREMQ03060 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CREMQ03060 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CREMQ03060 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CREMQ03060 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CREMQ03060 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CREMQ03060 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CREMQ03060 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CREMQ03060 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CREMQ03060 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CREMQ03060 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CREMQ03060 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CREMQ03060 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CREMQ03060 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CREMQ03060 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CREMQ03060 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CREMQ03060 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CREMQ03060 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CREMQ03060 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CREMQ03060 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CREMQ03060 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREMQ03060 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CREMQ03060 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CREMQ03060 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CREMQ03060 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREMQ03060 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREMQ03060 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CREMQ03060 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREMQ03060 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREMQ03060 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CREMQ03060 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREMQ03060 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREMQ03060 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREMQ03060 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREMQ03060 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CREMQ03060 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREMQ03060 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREMQ03060 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREMQ03060 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREMQ03060 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREMQ03060 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREMQ03060 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CREMQ03060 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREMQ03060 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CREMQ03060 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREMQ03060 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREMQ03060 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREMQ03060 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREMQ03060 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREMQ03060 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREMQ03060 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CREMQ03060 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CREMQ03060 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CREMQ03060 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CREMQ03060 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CREMQ03060 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CREMQ03060 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CREMQ03060 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CREMQ03060 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREMQ03060 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREMQ03060 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREMQ03060 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREMQ03060 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREMQ03060 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREMQ03060 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREMQ03060 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREMQ03060 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CREMQ03060 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CREMQ03060 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CREMQ03060 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREMQ03060 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREMQ03060 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREMQ03060 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREMQ03060 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREMQ03060 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREMQ03060 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREMQ03060 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms