Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPEQ02224 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPEQ02224 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPEQ02224 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPEQ02224 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPEQ02224 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPEQ02224 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPEQ02224 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms