Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1DQ01668 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1DQ01668 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA1DQ01668 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA1DQ01668 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA1DQ01668 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1DQ01668 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1DQ01668 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms