Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL7P80098 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCL7P80098 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCL7P80098 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCL7P80098 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL7P80098 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCL7P80098 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL7P80098 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCL7P80098 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL7P80098 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL7P80098 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL7P80098 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL7P80098 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL7P80098 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCL7P80098 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL7P80098 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL7P80098 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCL7P80098 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL7P80098 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL7P80098 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCL7P80098 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL7P80098 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCL7P80098 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL7P80098 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCL7P80098 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL7P80098 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL7P80098 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL7P80098 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCL7P80098 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL7P80098 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCL7P80098 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCL7P80098 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCL7P80098 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCL7P80098 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCL7P80098 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL7P80098 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCL7P80098 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL7P80098 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL7P80098 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCL7P80098 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCL7P80098 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL7P80098 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCL7P80098 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL7P80098 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL7P80098 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCL7P80098 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCL7P80098 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL7P80098 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL7P80098 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL7P80098 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL7P80098 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCL7P80098 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL7P80098 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL7P80098 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL7P80098 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL7P80098 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL7P80098 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL7P80098 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL7P80098 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL7P80098 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL7P80098 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL7P80098 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL7P80098 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL7P80098 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL7P80098 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL7P80098 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL7P80098 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL7P80098 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL7P80098 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL7P80098 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL7P80098 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL7P80098 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL7P80098 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL7P80098 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL7P80098 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL7P80098 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL7P80098 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL7P80098 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL7P80098 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL7P80098 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL7P80098 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL7P80098 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL7P80098 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL7P80098 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL7P80098 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCL7P80098 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL7P80098 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL7P80098 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCL7P80098 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL7P80098 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL7P80098 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCL7P80098 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCL7P80098 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms