Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NLRP11P59045 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP11P59045 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP11P59045 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP11P59045 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP11P59045 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NLRP11P59045 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP11P59045 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms