Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RABGGTBP53611 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RABGGTBP53611 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABGGTBP53611 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABGGTBP53611 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RABGGTBP53611 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABGGTBP53611 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RABGGTBP53611 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABGGTBP53611 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABGGTBP53611 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABGGTBP53611 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RABGGTBP53611 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABGGTBP53611 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RABGGTBP53611 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
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