Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2A1P52655 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2A1P52655 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2A1P52655 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF2A1P52655 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2A1P52655 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms