Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNI2P48788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNI2P48788 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNI2P48788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNI2P48788 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNI2P48788 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNI2P48788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNNI2P48788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNI2P48788 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TNNI2P48788 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TNNI2P48788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNNI2P48788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNNI2P48788 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms